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JA

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Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID

lcl|NW_015898598.1_cds_XP_016448634.1_43266

CDS Infomation

[gene=LOC107773724] [db_xref=GeneID:107773724] [protein=putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950] [protein_id=XP_016448634.1] [location=83297..86479] [gbkey=CDS]

Sequence

ATGTTTATGGCAGCACTTATACAAACACGACACAAACTACTACTCCATCAAAATCCAAAC
CCCACTTATACTTTCAGCACATTTGCAGCTTCAGTTCTTCAGTCTTTTTCGAATGACTTT
GCTTATCCCACCATCACTACAACAAAAGACAAAGCTTTTCATCCATACCAAAAGCCAACC
TATTTTGTTCCTACAGTTTCAGACAAGTGCGAGTTTCTCGTCCAAAAATACTTGTTTTCT
TGTTCTGAATTCAATGCGCAAAGACTCCATTTGGATATTATAAAAAATGGGGTTGATAAA
GATTTGTATTTGTGTAACACCCTTATTAATTTGTACGTCAAAAGTGGTGATTTGGTCTCT
GCCCATGATATGTTCGACAGAATGCTGGACAGAAATCTAGTTACCTGGGCGTGCTTGATT
ACGGGTTATTCGCGAAATGCGATGCCTGATGAGGCATGCCATGTTTTTCGTGAAATGGTT
TCGTCGGGGTTTATTCCTAATCATTATGCTTGTAGTAGTGCTTTGAGGGCTTGTCAGGGT
TTAGGTGCTTGTGGGCTTAGGTTGGGAATGCAAATTCATGGTTTGCTTTTGAAAACAGGA
CGTGCTTCTAATGAGGTTGTTTCCAATGTCTTGATCTCGATGTATGGAGGTTTTGCAGGT
ACTGGTGATTATCCATGGCGTGTTTTTGAAGAGATAGAGAATAAGAATTCAGCATCTTGC
AATTCTATTATTTCAGTTTACTCTCAGCGAGATGCAGTTTCTGTGTTTCAGCTCTTCTCT
GATATGCAAAAAGAAGATTTGGGGTTTATTTTTATACCAACTGAGTTCACTTTTGGCAGC
TTAATTACAGCTGCTGCTAAGCATGTTAATTATGGTTTGTCTTTGCTGAAGCAGCTACTG
GCTAAAATAGAAAAATCTGGACTTTTGGAAGACTTGTATGTAGGAAGTGCTCTGGTTAGT
GGTTTTGGAAGGTTTGGGTGTCTCGATACTGCTATGAAGGTTTTTAAACAGATGGGTACA
AGGAATGCAGTGTCCACGAACGGGCTCATGGTCGGATTGGTGAGACTGGGTCAAGGAGAA
GACGCGACCAGAGTTTTTATGCAGATGAGAGACTTGGTTAAAATCAATTCTGATTCATTC
GTTGTTCTTTTCGGTGCTTTTCATGAATTCTCTTTGTTGGAAGAAGGGAGAAGAAGAGGT
CGAGAGCTACATGCCTATGTTATCCGAACTGGTTTGTGTGACTCCAAGGCTGCTATTGGA
AATGCTCTGATTAATATGTATTCTAAATTTGGTGAAATCCAGATTGCTCGTTCTGTTTTT
GAGATCATGCTCGATAAGGATTCAGTATCATGGAACTCTATGATCTCCGCTCTAGATCAA
AATGATTGTTTTGAAGATGCAATATCAACCTTCCAAATTATGAGAAGAACAGGATTGATG
GCTTCAAATTACTCATTGATAAGTTCTTTGAGTTCTTGTGGAAACCTGAATTGGATAAGA
TTGGGGGAACAACTGCACAGTGAAGGGATAAAGTTAGGACTAGATTTTGATGTTTCAGTG
TCTAATGCTCTTCTTGCTTTGTATGCTGATACTGGATGTGTGACTGAATGCAAGAAATTG
TTTACCTTAATGCCAGAGTATGATCTTGTTTCATGGAATACCATTATCGGTGCATTAGGT
GATTCTGAGACATCTATTTCTGAAGCTATAGAGAACTTCACACAGATGATGCGTGCTGGA
TGGAGTCTCAACAATGTGACGTTTATAAATATCCTTTCAGCAATATCATCACTTTCTCTT
CTTGGTCTTGTTCGTCAAATCCATGCTCTGGTGCTAAAATATAGTGGAATGGATGCTAAT
GCTATTGAAAATTCATTTCTTGCTTGCTATGGTAAGTGCGGGGAAATGGATGACTGTGAG
AACATATTCTCTCGGATGTCTGACAGGAAGGATGATATGAGTTGGAATCTAATGATCTCT
GGATATTTACACAATGAGGTCTTACCAAAAGCCATGGATTTAGTCTGGCTTATGCTGCAC
AAGGGTCAGAAATTAGATGGCTTCACATTTGCCTCTGTTCTCAGTGCATGTGCCTCAATT
GCAACATTGGAGCATGGCATGGAAGTTCATGCTTGTGCGATTAGATCCTGTTTGGAATCT
GACGTTGTTGTTGGGAGTGCTCTTGTTGACATGTATGCCAAATGTGGAAGAATAGATTAT
GCTTCCAGGTTTTTTGAGTTGATGCCAGTACGAAATATATATTCATGGAACTCAATGATT
TCTGGTTATGCACGGCATGGACATGGACATAAAGCACTAGAGCTTTTTACAAAAATGAAG
CTGGAAGGTCAAACACCTGACCATGTCACTTTTGTTGGTGTCTTATCAGGTTGTAGCCAC
GTGGGATTTGTTGAGCAGGGCATGGATTACTTTGATTCCATGAGCAAACAATATGGTCTG
ACACCACGGATTGAGCATTTCTCATGCATGGTTGATATCCTGGGACGAGCAGGTCAGATG
GATAAATTGGAGGACTTCGTCAACAAAATGCCATTAAAACCCAATGCACTCATTTGGAGG
ACTGTGCTTGGAGCCTGTGGTCGAGCAGGCGGTCGTAAAACAGATCTAGGTAGGAAGGCT
GCTCACATGCTCTTAGAGCTGGAACCTCATAATGCTGTGAACTATGTGCTTCTTGCAAAT
ATGTACGCTTCGGGAGGGAAATGGGAGGATGTGGCAGAGGCTCGGCGTGCAATGCGAGAA
GCTACGGTAAGGAAAGAAGCTGGATGCAGTTGGGTTAACATGAGAGATGGTGTTCATGTT
TTTGTAGCTGGTGATCAATCACATCCAGATAAAGACGCAATTTATGAAAAACTTAAGGAA
TTGCACAAGAAGATTAGGGACGCAGGGTATGTGCCACAGATTAAATATGCCTTGTATGAT
CTTGAACTGGAGAATAAGGAAGAACTCCTCAGCTATCATAGCGAGAGACTTGCAGTTGCC
TTTGTTCTTACACGGAAATCAGATATGCCGATAAGAATAATGAAAAACCTCCGAGTTTGT
GGGGACTGTCACTCTGCCTTCAAATACATATCACAAGTTGTTGGTAGACAAATAGTATTA
CGAGACTCCAACAGATTTCATCATTTTTTTGATGGAAAGTGTTCATGTAACGATTACTGG
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

XP_016448634.1

PEP Infomation

PREDICTED: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950 [Nicotiana tabacum]

Sequence

MFMAALIQTRHKLLLHQNPNPTYTFSTFAASVLQSFSNDFAYPTITTTKDKAFHPYQKPT
YFVPTVSDKCEFLVQKYLFSCSEFNAQRLHLDIIKNGVDKDLYLCNTLINLYVKSGDLVS
AHDMFDRMLDRNLVTWACLITGYSRNAMPDEACHVFREMVSSGFIPNHYACSSALRACQG
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ASNYSLISSLSSCGNLNWIRLGEQLHSEGIKLGLDFDVSVSNALLALYADTGCVTECKKL
FTLMPEYDLVSWNTIIGALGDSETSISEAIENFTQMMRAGWSLNNVTFINILSAISSLSL
LGLVRQIHALVLKYSGMDANAIENSFLACYGKCGEMDDCENIFSRMSDRKDDMSWNLMIS
GYLHNEVLPKAMDLVWLMLHKGQKLDGFTFASVLSACASIATLEHGMEVHACAIRSCLES
DVVVGSALVDMYAKCGRIDYASRFFELMPVRNIYSWNSMISGYARHGHGHKALELFTKMK
LEGQTPDHVTFVGVLSGCSHVGFVEQGMDYFDSMSKQYGLTPRIEHFSCMVDILGRAGQM
DKLEDFVNKMPLKPNALIWRTVLGACGRAGGRKTDLGRKAAHMLLELEPHNAVNYVLLAN
MYASGGKWEDVAEARRAMREATVRKEAGCSWVNMRDGVHVFVAGDQSHPDKDAIYEKLKE
LHKKIRDAGYVPQIKYALYDLELENKEELLSYHSERLAVAFVLTRKSDMPIRIMKNLRVC
GDCHSAFKYISQVVGRQIVLRDSNRFHHFFDGKCSCNDYW

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.